コンパイルなし、yum でおこなう方法です。

» DevGuy :: View topic - Remove mysql 4 and install mysql 5

にそのままずばり書いてありますが、リンク先がなくなってしまうかもしれないので、念のため日本語説明付きで書き写しておきます。

(1)

# sudo yum remove mysql

# sudo yum remove mysql-server

# sudo yum remove mysql-libs

(2)

/etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo を以下のように修正

[base] と [update] セクションに

enabled=0

を追加。

[centosplus] セクションに

enabled=1

を追加します。

(3)

# sudo yum install mysql-server

(4)

/etc/yum.repos.d/CentOS-Base.repo を元に戻しておきます。

[base] と [update] セクションは

enabled=1

[centosplus] セクションは

enabled=0

mysql に限らず、yum で最新のバージョンが入らないときに上記方法が使えるかも。